Marco Pereira teve o primeiro contacto com o violoncelo aos 13 anos na Escola Profissional de Música de Viana do Castelo. Prosseguiu os estudos em Lisboa, na Academia Nacional Superior de Orquestra, com Paulo Gaio Lima, onde finalizou o Curso com 20 valores, e posteriormente em Madrid , na Escuela Superior de Musica Reina Sofia, com Natalia Shakovskaya. Durante este percurso teve a oportunidade de trabalhar com os maiores mestres do violoncelo, como por exemplo, Natalia Gutman, Gary Hoffman, Phillipe Muller, Ivan Moneghetti, entre muitos outros. 

Desde cedo, o quarteto de cordas está muito presente na carreira de Marco Pereira, onde atinge o seu auge na formação do quarteto de cordas de Matosinhos, como membro fundador. Este quarteto foi nomeado “Rising Stars”na temporada 2015/2016 da ECHO, onde teve oportunidade de fazer uma série de concertos pelas principais salas da Europa tais como Barbican (Londres), Concertgebouwn (Amsterdão), Musikverein (Viena).

Marco Pereira fez inúmeros concertos a solo, recitais e concursos que impulsionaram a sua carreira, conquistando um lugar de prestígio no meio musical português e internacional.  Dos concursos pode destacar-se  o concurso Juventude Musical Portuguesa onde foi vencedor de Música de Câmara em 1999 e Violoncelo – nível superior, em 2003, ano em que conquistou também o “prémio Maestro Silva Pereira”do Prémio Jovens Músicos. A nível internacional destaca-se o 1º prémio no “Liezen International Wettbewerb für Violoncelo” na Áustria, na  categoria “III Konzert”. Venceu também o 1º prémio no “VI Certamen de Musica de Camara del Sardinero” em Santander,  em 2006. Foi também laureado no Concurso de Interpretação do Estoril, Julio Cardona, entre outros. Apresentou-se a solo com a Orquestra Gulbenkian, Orquestra Metropolitana de Lisboa, Orquestra Sinfónica Portuguesa, Joensuu Orchestra (Finlândia), Atlantic Music Festival Orchestra (USA), entre outras.

Gravou inúmeros Cd ‘s para violoncelo solo, quarteto de cordas e outras formações. 

Foi professor de violoncelo na Universidade de Aveiro, na Universidade do Minho e na ANSO. Atualmente é Premier Soliste na Orchestre Philharmonique Royal de Liège e Primeiro Solista na Orquestra Gulbenkian, bem como convidado regular na Nederlands Philharmonisch Orkest.